Počátkem devadesátých let založil se svým obdobně nadaným bratrem dnes velmi uznávanou skupinu Spock's Beard. Debutovali v roce 1994 diskem The Light, který se setkal s velkým posluchačským zájmem. Ani kritici nešetřili pochvalnými recenzemi, což je jev vpravdě vzácný! O několik let později začal Neal velmi silně inklinovat k náboženství a v roce 2000 se připojil k mezinárodnímu projektu Transatlantic v čele s bubeníkem Dream Theater Mikem Portnoyem. Zde se potkal s lidmi z Marillion, The Flower King a Pain Of Salvation. Zároveň rozjel i vlastní kariéru. Ročně vydával jednu až tři desky a k tomu několik DVD, která mapují celou jeho kariéru. Koncertní zastavení tohoto všestranného umělce osloví převážně fanoušky Yes, King Crimson, Jethro Tull, Marillion, Gentle Giants nebo Genesis a Petera Gabriela. Neal Morse kromě toho, že hraje na kytaru, baskytaru, klávesy i bicí nástroje, ještě zpívá.